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【AAV】DLS+SEC+DSC多種技術結合,助力AAV基因遞送載體的表征

【AAV】DLS+SEC+DSC多種技術結合,助力AAV基因遞送載體的表征
馬爾文帕納科  2022-09-20  |  閱讀:2363

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DLS+SEC+DSC多種技術結合

助力AAV基因遞送載體的表征



部分Covid-19疫苗通過引入mRNA來觸發(fā)對SARS-CoV-2冠狀病毒刺突蛋白的免疫反應。遞送mRNA的載體之一有腺相關病毒(AAVs)。有很多生物物理的技術可以為候選疫苗的研究和開發(fā)提供新的見解。比如光散射技術可用于測量病毒衣殼的濃度,比ELISA方法更迅速;色譜技術可用于測量空殼率;完整衣殼可在微量熱技術中顯示出不同的特征。



1

DLS 動態(tài)光散射技術


DLS可用于樣品關鍵生物物理參數(shù)的測量,或用于篩分優(yōu)質(zhì)、穩(wěn)定的的樣品和那些受污染、有聚體的樣品。通過Zetasizer Ultra納米分析儀的多角度動態(tài)光散射技術(MADLS),不僅可以在幾分鐘內(nèi)測量樣品的流體動力學直徑和粒徑分布(包括聚集體),還可以測量每個群體的顆粒濃度。此外,儀器新的自適應相關算法提高了測量精度、重現(xiàn)性,以及對異物或大的聚集體的包容度。

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圖1. Zetasizer Ultra納米粒度儀和DLS測量粒徑分布的案例


使用MADLS技術

進行AAV載體大小和濃度測量


本文用Zetasizer Ultra分析了3個AAV樣品。濃度結果與基于衣殼ELISA的病毒滴度測定的結果進行對比。


采用多角度動態(tài)光散射(MADLS)技術測量3個AAV樣品的顆粒大小分布,重復測量3次,結果如下。顯示有少量樣品團聚。標準品(A)發(fā)生的團聚比AAV樣品(B和C)更多一些。同時分別測得了AAV單體和團聚體的顆粒濃度,結果見圖D-F。表1中對比了MADLS方法和衣殼ELISA法測得的濃度結果。AAV樣品的RSD<15%,ATCC AAV2參考標準品的RSD 45%。


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圖2. 顆粒大小分布的3次重復測量結果:圖A-ATCC AAV2標品,圖B-AAV樣品1,圖C-AAV樣品2。圖D-F的顆粒濃度結果一一對應圖A-C中的樣品。


采用AAV衣殼ELISA方法進行測量


酶聯(lián)免疫吸附試驗 (ELISA) 是病毒滴度或衣殼濃度的標準測量方法。我們將MADLS濃度數(shù)據(jù)與已有的衣殼ELISA方法測量的數(shù)據(jù)進行比較。單分散rAAV樣品(RSD 13-15%)與ELISA方法測量的rAAV衣殼滴度幾乎沒有差異。


這些結果表明了完整 rAAV 衣殼的無標記分析方法與其他常見滴度測定方法是互補的。發(fā)生團聚的多分散rAAV樣品的RSD高達45%。我們認為這是因為多分散樣品的尺寸精度較低。


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表1. 衣殼ELISA測得的濃度數(shù)據(jù)和MADLS測定的顆粒濃度數(shù)據(jù),3個樣品分別是ATCC AAV2參考標準品,樣品1,樣品2。濃度數(shù)據(jù)單位是顆粒數(shù)量/ml。n表示3次重復測量中觀察到該峰的次數(shù)。n/a表示未觀察到該峰。


2

SEC尺寸排阻色譜技術


多檢測器尺寸排阻色譜(SEC)可用于多種rAAV屬性的測量,如衣殼滴度、絕對分子量、聚集體、寡聚體、片段分布和空殼率。


市售rAAV5樣品(Virovek,US)含有空衣殼和完整衣殼的混合物。完整衣殼rAAV樣品Mw是4.49x106 g/mol,蛋白質(zhì)含量86%,ssDNA Mw 6.13x105 g/mol,完整衣殼AAV占比78.1%,總滴度7.48x1013(單體和聚集體)。空rAAVs Mw小一些,3.84x106 g/mol,總滴度5.91x1013(單體和聚集體)。當空衣殼和完整衣殼以已知比例添加時,測得的空殼率與預測結果高度相關,R2高達0.99。


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圖3. OMNISEC系統(tǒng)和示例色譜譜。示例中樣品為空rAAV單體、二聚體、高聚體和片段的混合物。針對單體峰進行空殼率分析。


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圖4. OMNISEC空殼率分析結果。預估值(表格第三列)來自添加的空衣殼和完整衣殼比率,調(diào)整到100%。基于Mw得到完整衣殼占比 78.1%。計算值(表格第四列)基于單體峰的Mw值得到。


3

DSC 差示掃描量熱技術


差示掃描量熱儀(DSC)可用于測量蛋白質(zhì)、核酸和病毒衣殼的熱變性和熱穩(wěn)定性。該技術測量溶液中分子熱誘導的結構變化的焓變(ΔH)和結構轉變溫度(Tm)。該測量方式直接、溶液相和非標記,不需要額外的熒光標記或抗體捕獲。


空衣殼和完整衣殼rAAV5樣品(Virovek, US)的PEAQ-DSC結果顯示有多個轉變溫度(Tm),與衣殼分解(Tm1)和ssDNA熔融(Tm2)有關。此外,完整rAAVs在50度時顯示出弱的熱特征,而空殼rAAVs沒有,這表示熱誘導事件的發(fā)生可能與衣殼脫殼相關的完整rAAVs里的結構重組有關。


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圖5. MicroCal PEAQ-DSC自動系統(tǒng)和完整rAAV的DSC熱圖譜示例。圖譜顯示了明顯的熱轉變溫度(Tm)分別是89°和94°。紅星號標注出早期的熱轉變發(fā)生在50°。



  總結  


1, 衣殼ELISA方法和MADLS方法測得的顆粒濃度結果的RSD≤15%。有團聚顆粒時RSD為45%。


2, 多檢測器SEC色譜儀可用于測量空衣殼和完整rAAVs的純度、寡聚分布和空殼率。


3, 使用DSC表征衣殼分解和ssDNA熔融時空衣殼和完整rAAVs的不同熱轉變和熱穩(wěn)定性行為。



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